Более 20 лет применения MMANA, а вот насчет пересечений проводов не встречался. А почему так нельзя? Некорректный расчет из-за близости проводов?
Сегменты в разных проводах могут оказаться недопустимо близко. Причем, т.к. сегментация меняется с частотой (привязана к длине волны), могут появиться чудеса, когда на большинстве частот результат более-менее правильный (MININEC довольно терпимо относится к чрезмерно близким сегментам), а на одной-двух (например, при расчете в полосе) получается странный вылет.
Обычно распределение сегментов юзером контролируется чуть лучше, чем никак, а вот положение проводов и их взаимное расположение в окне Правка провода видно пользователю гораздо лучше, чем сегменты.
К сожалению, полностью автоматическую проверку координат всех сегментов по всем частотам сделать весьма проблемно. Поэтому автоматически проверяются ошибки модели не на недопустимое сближение координат сегментов в разных проводах, а на пересечение и\или дублирование проводов (только в PRO версии) с сообщением какие именно провода пересекаются или дублируются. Это сильно помогает исправлять ошибки в сложных антеннах с многими сотнями проводов. Учитывая что такие антенны рисуются не за один присест и потом редактируются, вероятность таких ошибок на сложных антеннах сильно возрастает.